MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 8305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012469	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012469	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012469	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012469	CTAT	2	8	138	145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012469	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012469	T	6	6	1577	1582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012469	T	6	6	1586	1591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012469	T	6	6	1599	1604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012469	A	6	6	1614	1619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012469	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012469	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012469	ATAA	2	8	1699	1706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012469	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012469	TTAG	2	8	3119	3126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012469	A	7	7	3281	3287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012469	CAG	2	6	3318	3323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012469	T	7	7	3351	3357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012469	TAT	2	6	3379	3384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012469	CCT	2	6	3990	3995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012469	ATA	2	6	4003	4008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012469	AG	3	6	4036	4041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012469	T	6	6	4051	4056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012469	AAG	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012469	GTC	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012469	AGG	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012469	TTA	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012469	T	7	7	5190	5196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012469	ATCT	2	8	5357	5364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012469	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012469	GTT	2	6	5427	5432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012469	GT	3	6	5509	5514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012469	TCTG	2	8	5518	5525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_012469	A	7	7	5534	5540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012469	TAG	2	6	6119	6124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012469	T	6	6	6387	6392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012469	A	6	6	6420	6425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012469	CTA	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012469	TA	3	6	6503	6508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012469	TA	4	8	6514	6521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012469	T	6	6	6525	6530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012469	CTA	2	6	6560	6565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012469	T	6	6	6632	6637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012469	T	6	6	6675	6680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012469	TTG	2	6	9863	9868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012469	T	6	6	9926	9931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012469	GTT	2	6	10438	10443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012469	T	6	6	11297	11302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012469	T	6	6	11352	11357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012469	GTT	2	6	11360	11365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012469	T	7	7	11376	11382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012469	TTGC	2	8	11484	11491	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012469	TTCGT	2	10	11518	11527	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012469	CCT	2	6	12557	12562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012469	GAC	2	6	12568	12573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012469	ATT	2	6	12578	12583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012469	ATT	2	6	12587	12592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012469	GTC	2	6	12593	12598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012469	A	7	7	12621	12627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012469	TTATT	2	10	12650	12659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012469	TAT	2	6	12685	12690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012469	GCTT	2	8	12736	12743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012469	T	8	8	12770	12777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012469	TTC	2	6	14017	14022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012469	ATT	2	6	14085	14090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012469	CTTAG	2	10	14125	14134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012469	T	6	6	14150	14155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012469	T	6	6	14169	14174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012469	A	6	6	14182	14187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012469	A	7	7	14216	14222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012469	AAAG	2	8	14228	14235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012469	A	6	6	15607	15612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012469	GAG	2	6	15631	15636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012469	CAG	2	6	15681	15686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012469	GAG	2	6	15706	15711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012469	GAA	2	6	15712	15717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012469	GA	3	6	15760	15765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012469	ATGA	2	8	15769	15776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012469	CTTT	2	8	16040	16047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012469	T	7	7	16110	16116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012469	ATTTT	2	10	16118	16127	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012469	T	9	9	16129	16137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012469	AATTA	2	10	16171	16180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012469	A	7	7	16956	16962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012469	ACC	2	6	17644	17649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_012469	T	6	6	17665	17670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012469	GAA	2	6	17702	17707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012469	ACA	2	6	18442	18447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012469	A	10	10	18447	18456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012469	AGCT	2	8	18461	18468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012469	GCT	3	9	18466	18474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012469	CTGAA	2	10	18492	18501	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_012469	TAG	2	6	18525	18530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012469	GA	3	6	18537	18542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012469	TAT	3	9	18605	18613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012469	TGAC	2	8	18635	18642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012469	TCA	2	6	18657	18662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012469	A	8	8	18759	18766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012469	T	6	6	18874	18879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012469	CT	3	6	19369	19374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012469	CTTTT	2	10	19412	19421	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012469	TAT	2	6	19431	19436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012469	G	7	7	19463	19469	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012469	CGA	2	6	19571	19576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012469	C	6	6	19580	19585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_012469	T	6	6	19586	19591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012469	GTA	2	6	19613	19618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012469	A	6	6	19628	19633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012469	GTT	2	6	19672	19677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012469	AATA	2	8	19680	19687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012469	T	7	7	19882	19888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012469	GTA	2	6	19937	19942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012469	TAG	2	6	19958	19963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012469	A	6	6	20149	20154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012469	T	7	7	20183	20189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012469	TAT	3	9	20203	20211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012469	ATTT	2	8	20232	20239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012469	AG	3	6	20240	20245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012469	AT	3	6	20516	20521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012469	A	6	6	20543	20548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012469	T	6	6	20566	20571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012469	TAG	2	6	20585	20590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012469	TAC	2	6	20642	20647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012469	A	7	7	20661	20667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012469	T	6	6	20678	20683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012469	GTT	2	6	20705	20710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012469	A	6	6	20714	20719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012469	A	6	6	20732	20737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012469	CTA	2	6	21130	21135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012469	TTG	2	6	21139	21144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012469	CAA	2	6	21149	21154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012469	GAA	2	6	21865	21870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012469	T	7	7	21876	21882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012469	A	6	6	21933	21938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012469	A	6	6	21957	21962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012469	CAAA	2	8	21963	21970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_012469	ATA	2	6	21992	21997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012469	TGA	2	6	22014	22019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012469	TAT	2	6	22071	22076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012469	TTGC	2	8	22157	22164	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_012469	CTG	2	6	22165	22170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012469	ATT	3	9	23371	23379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012469	TGAAA	2	10	23451	23460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012469	TAA	2	6	24597	24602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012469	A	7	7	24622	24628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012469	TCT	2	6	28749	28754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_012469	AAT	2	6	28777	28782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012469	TAA	2	6	28792	28797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012469	GA	3	6	34614	34619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012469	CT	3	6	34629	34634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012469	T	6	6	34634	34639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012469	A	8	8	35221	35228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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